As primeiras prospecções de fósseis de pterossauros no Brasil tiveram grande êxito na região da Chapada do Araripe, sendo a primeira espécie de Anhanguera batizada em 1985. Dezenas de outros restos incompletos desses répteis alados foram coletados e estudados no Brasil e no exterior, fornecendo a imagem de uma pré-história brasileira repleta de diferentes tipos de animais voadores.

   Anhanguera piscator foi descrito no ano 2000, pelos paleontólogos Alexander Kellner e Yukimitsu Tomida, sendo que o fóssil do pterossauro pertence ao Museu Nacional da Natureza e Ciência da cidade de Tóquio, no Japão. A análise indica a possibilidade do fóssil ter sido coletado nos arredores da cidade brasileira de Santana do Cariri, estado do Ceará. O translado do material fóssil até o Japão ocorreu por vias irregulares, no contexto do comércio ilegal de fósseis, conforme as leis brasileiras desde 1942.

  O traficante em questão foi o italiano Flavio Bacchia, já investigado pela Polícia Federal, sendo que o mesmo disse jamais ter estado no Brasil e comprado o fóssil na década de 90 de um alemão já falecido. O museu japonês anunciou a presença do fóssil em 1992, sendo então feita uma parceria para estudo em conjunto do material, com cada país representado por um pesquisador, Kellner e Tomida, respectivamente. Na época, através de uma declaração à imprensa, o paleontólogo japonês Tomida disse desconsiderar a legislação brasileira quanto a ilegalidade da venda do fóssil, pois para ele se estão vendendo então está tudo legal. O estado do Ceará entrou com o pedido de repatriamento em 2002, porém o fóssil não retornou até os dias de hoje.

     Enfim, a descoberta desta espécie de Anhanguera corroborou em demonstrar a variabilidade desses pterossauros durante o Cretáceo, a fauna dos diversos tipos de Anhangueras no Brasil e a possibilidade de estudar melhor esses animais, já que o Anhanguera piscator contém praticamente todos os fósseis preservados, ainda articulados e em excelente estado tridimensional de preservação. Isto possibilita uma melhor comparação e estudos por parte dos pesquisadores.